根据国家税务总局《关于调整个人取得全年一次性奖金等计算征收个人所得税方法问题的通知》(国税发[2005]9号)规定，对于纳税人取得全年一次性奖金，单独作为一个月工资、薪金所得计算纳税。
国税发[2005]9号文件基本规定是：“纳税人取得全年一次性奖金，应单独作为一个月工资、薪金所得计算纳税”。
年终奖个人所得税计算方式：
1、发放年终奖的当月工资高于5000元时，年终奖扣税方式为：年终奖*税率-速算扣除数，税率是按年终奖/12作为“应纳税所得额”对应的税率。
2、当月工资低于5000元时，年终奖个人所得税=(年终奖-(5000-月工资))*税率-速算扣除数，税率是按年终奖-(5000-月工资)除以12作为“应纳税所得额”对应的税率。
这里我们以一个示例进行计算演示：
小王在2013年12月工资6000元，同时领到2013年的年终奖20000元，当月所需缴纳的个人所得税如下：
1)当月工资个人所得税=(6000-5000)*10%-105=0元
2)年终奖个人所得税=20000*10%-105=1895元
当月个人所得税总额=0+1895=1895元
由于单位发放给员工的年终奖形式不同，个人所得税计算方法也不尽相同。
一、员工当月的工资薪金超过「5000」元，再发放的年终奖单独作为一个月的工资计算缴纳个人所得税。
全年一次性奖金，单独作为一个月计算时，除以12找税率，但计算税额时，速算扣除数只允许扣除一次。
例一：赵某2013年1月工资5000，年终奖24000，无其它收入。
赵某工资部分应缴纳个人所得税：(5000-5000)*3%=0元
赵某年终奖(24000)部分应缴纳个人所得税计算：
先将雇员当月内取得的全年一次性奖金，除以12个月，即：24000/12=2000元，
再按其商数确定适用税率为10%，速算扣除数为105.
赵某年终奖24000应缴纳个人所得税：
24000*10%-105=2295元。
赵某2013年1月份应缴纳个人所得税2295元。
二、员工当月的工资薪金不超过5000元，再发放的年终奖单独作为一个月的工资计算缴纳个人所得税。
但可以将全年一次性奖金减除“雇员当月工资薪金所得与费用扣除额的差额”后的余额，作为应纳税所得额。其中“雇员当月工资薪金所得”以收入额扣除规定标准的免税所得(如按规定缴纳的社会保险和住房公积金等)后的数额。
例二：钱某2013年1月工资2000，年终奖24000，无其它收入。
钱某当月工资2000元，未超过费用扣除标准5000元，不需要缴纳个人所得税。
钱某2013年1月当月工资薪金所得与费用扣除额的差额为5000-2000=3000元。
三、员工一个年度在两个以上单位工作过，只能按照国税发[2005]9号文件规定，在一个纳税年度内，对每一个纳税人年终奖计税办法只允许采用一次，纳税人可以自由选择采用该计税办法的时间和发放单位计算。
该条款的要点是：
1，一个员工2013年1月发放的年终奖适用了除以12找税率的优惠计算政策，2013年其它月份就不能再适用了。
2，一个员工一年一次，在两处以上取得年终奖，也只能适用一次。
3，员工即使工作时间不足12个月，也可以适用一次。
例三：孙某2012年1-3月在石油企业工作，2012年4-8月跳槽到电信企业，2012年9月至今跳槽到房地产企业工作，
如果孙某2012年12月在房地产企业取得工资5000，年终奖24000，其它无收入，虽然钱某只2012年在房地产企业工作4个月，但其应缴纳个人所得税与例一赵某相同，即当月工资部分应缴纳个人所得税45，年终奖部分也是除12找税率，应缴纳个税2295元。
房地产企业计提年终奖时，计提、发放会计处理同例一。
四、员工同一月份在两个以上单位取得年终奖，可以选择一个单位的一次性奖金按照国税发[2005]9号文件优惠办法计算，从另一单位取得的年终奖合并到当月工资薪金项目缴税。
国税发[2005]9号文件规定：“在一个纳税年度内，对每一个纳税人，该计税办法只允许采用一次”。如果同一个人同月在两个企业都取得了年终一次性奖金，纳税人在自行申报时，不可以将这两项奖金合并计算缴纳个人所得税，享受一次性奖金的政策;对该个人按规定只能享受一次全年一次性奖金的优惠算法。
例四：李某2013年1月工资5000，取得本企业发放的年终奖24000元，另取得兼职单位发放的年终奖6000元，无其它收入。
李某本企业年终奖(24000)部分应缴纳个人所得税计算：先将雇员当月内取得的全年一次性奖金，除以12个月，即：24000/12=2000元，
再按其商数确定适用税率为10%，速算扣除数为105.
李某本企业年终奖24000应缴纳个人所得税：
24000*10%-105=2295元。
李某取得的兼职单位发放6000元年终奖应合并到李某当月工资薪金中计算缴纳。如果兼职单位按发放年终奖计算个人所得税，代扣代缴了个人所得税6000*3%=180元。
李某在本企业取得工资5000元，本企业代扣代缴(5000-5000)*3%-=0元个人所得税。
